大まかに、主にクリニックで行われている方法と、主にエステで行われている方法の２つに分けることができます。
クリニックでは、医療電気脱毛、医療レーザー脱毛が行われていて、エステでは、電気脱毛、IPL脱毛が主流。
これらの違いは、クリニックで行われている方法のほうが、強力であるということ。
クリニックは医療機関で、必ず医療資格を持ったドクターがいるため、高い出力で高い効果を発揮できる機器の使用が許可されています。
一方エステでは、低出力の機器しか使用できず、その機器のハイパワーで施術を行うことはまずありません。
万が一トラブルの際、治療行為を行えるものがいないためです。
ただし、最近では医師や医療機関と提携し、万一の際のケアに力を入れるエステも増えてきているようです。
クリニックは、医療機関ですので、医療資格を有したドクターか、またはそのドクターの管理下のもとに置かれた看護師が施術を行います。
エステは、エステティシャンが行うことが基本。
医療資格は持ち合わせていないものの、たとえばアメリカ脱毛学会が認定する「CPE」といった資格を有する者が行うこともあります。
クリニックとエステの技術レベルは、一概にどちらが高いとはいえませんが、「医療行為ができる」という点に注目すれば、クリニックのほうが安心できるといえるのではないでしょうか。
また、技術力を見極める際は、症例数（施術数）を見てみてもいいでしょう。
症例数（施術数）が多い→それだけ豊富な経験があるといえるでしょうから。
料金は、店によって本当にバラバラで、不定期でキャンペーンと銘打ち割引料金を提示している場合も頻繁にあり、また施術の方法や内容も違いますので、単純にエステとクリニックの料金を比較することはできません。
それでも、同じようなプランを見てみると、エステのほうが安く感じことがありますよね。
低料金の理由として考えられるのは、薄利多売（一人あたりの利益は少ないが数を売っているから）、
勧誘のエサ（とにかくきてもらうことで他の商品を販売するための勧誘の場づくりをしている）といったことがあげられるのではないでしょうか。
いずれにしろ、パッと見の料金の安い・高いではなく、サービス内容や対応なども考慮に入れて、これなら納得できるといったものを選ぶといいでしょう。